L’application StopCovid fait l’objet d’une enquête préliminaire du Parquet national financier (PNF) pour "favoritisme", visant plus particulièrement une filiale de Dassault Systèmes, Outscale, chargée de sa maintenance. L’enquête fait suite à la plainte déposée par Anticor, qui considère que sa maintenance payante, facturée 200 000 euros à 300 000 euros mensuels, aurait dû faire l’objet d’un appel d’offres. L’information a peu fuité : l’enquête a été ouverte dès septembre 2021.

L’association Anticor assure n’avoir trouvé aucune publication pour des marchés publics relatifs à l’application StopCovid : «  le choix de recourir à la société Outscale en tant qu’attributaire du marché de maintenance de l’application StopCovid n’a fait l’objet d’aucune procédure de passation de marché public ». L’association, dans une plainte déposée jeudi 20 mai auprès du PNF, n’attaque pas que le contrat passé avec Outscale, mais tous les marchés publics passés dans le cadre de l’application StopCovid et n’ayant pas fait l’objet d’un appel d’offres.

Dans la presse, Cédric O, secrétaire d’État chargé de la Transition numérique, réagit : « Non, si les choses ont été faites dans l’urgence, elles ont été faites dans les règles.» Et d'ajouter : « Il s'agit d’un projet souverain, qui ne dépend pas d’Apple, ni de Google. Le seul intérêt poursuivi a été l’intérêt général. Je ne vais pas m’excuser d’avoir déployé StopCovid ! »